2016年總統選舉於2016年1月16日舉行。澎湖縣的選舉概況如下，人口數：102,317，選舉人數：84,222（選舉人比例：82.31%），投票數：43,266（投票率：51.37%），有效票：42,623（有效率：98.51%），無效票：643（無效率：1.49%）。
澎湖縣投票結果
| 2016年總統選舉澎湖縣投票結果
|
| 號次 |
候選人 |
性別 |
年齡 |
學歷 |
政黨 |
得票數 |
得票率 |
現任 |
當選
|
| 1 |
朱立倫 |
男 |
54（1961年） |
博士 |
中國國民黨
|
12,564
|
29.47% |
|
|
| 王如玄 |
女 |
54（1961年） |
碩士 |
中國國民黨 |
|
| 2 |
蔡英文 |
女 |
59（1956年） |
博士 |
民主進步黨
|
21,658
|
50.81% |
|
✅
|
| 陳建仁 |
男 |
64（1951年） |
博士 |
民主進步黨 |
|
| 3 |
宋楚瑜 |
男 |
73（1942年） |
博士 |
親民黨
|
8,401
|
19.71% |
|
|
| 徐欣瑩 |
女 |
43（1972年） |
博士 |
親民黨 |
|
| 投票日：2016年1月16日，人口數：102,317，選舉人數：84,222（選舉人比例：82.31%），投票數：43,266（投票率：51.37%），有效票：42,623（有效率：98.51%），無效票：643（無效率：1.49%）
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全國投票結果
全國
澎湖縣選舉概況
| 行政區 |
人口數 |
選舉人數 |
選舉人比例 |
投票數 |
投票率 |
有效票 |
有效率 |
無效票 |
無效率
|
| 澎湖縣 |
102,317 |
84,222 |
82.31% |
43,266 |
51.37% |
42,623 |
98.51% |
643 |
1.49%
|
| 馬公市 |
60,914 |
49,181 |
80.74% |
27,553 |
56.02% |
27,177 |
98.64% |
376 |
1.36%
|
| 七美鄉 |
3,759 |
3,148 |
83.75% |
1,000 |
31.77% |
977 |
97.70% |
23 |
2.30%
|
| 望安鄉 |
5,100 |
4,367 |
85.63% |
1,217 |
27.87% |
1,197 |
98.36% |
20 |
1.64%
|
| 湖西鄉 |
14,404 |
12,175 |
84.53% |
6,411 |
52.66% |
6,296 |
98.21% |
115 |
1.79%
|
| 白沙鄉 |
9,714 |
8,207 |
84.49% |
3,633 |
44.27% |
3,593 |
98.90% |
40 |
1.10%
|
| 西嶼鄉 |
8,426 |
7,144 |
84.79% |
3,452 |
48.32% |
3,383 |
98.00% |
69 |
2.00%
|
澎湖縣投票明細
馬公市
七美鄉
望安鄉
湖西鄉
白沙鄉
西嶼鄉